Церковь построена трявненским мастером Уста Генчо в 1889 году для нужд беженцев из районов, которые были в подчинении Константинопольского (Цареградского) патриархата (это дало храму второе неофициальное название – «церковь для беженцев»). Во времена строительства церковь находилась за пределами города и богослужения там совершались только по большим праздникам.
Здание представляет собой однонефную базилику длиной 25 м., шириной 13 и высотой 12 м. В более позднее время была пристроена колокольня высотой около 23 метров. В церкви хранится резной иконостас работы мастеров дебарской школы XVII-XVIII века, который был перевезен сюда из разрушенного в XIX веке созопольского храма Св. Иоанна Богослова.
После 1944 года церковь была превращена сначала в городской музей, потом в склад и, наконец, в музей подводной археологии. С 1989 года здание возвращено Болгарской Православной Церкви. После продолжительной реконструкции в 2011 году храм был снова открыт для посетителей и проведения богослужений
В нашем понимании это кафедральный собор. Построен недавно по всем канонам, обязательным для культовых православных зданий. Величественный, строгий,с достоинством возвышающийся в отрешенном молчании посреди бурлящей толпы туристов в старинном уютном Созополе. В соборе входящие становятся тихими и задумчивыми, обретая ощущения покоя и радости жизни