В сентябре климат в Балыкче можно охарактеризовать как холодный. Средняя температура днём в сентябре 9 градусов тепла. В среднем в сентябре в Балыкче 16 дождливых, 9 ясных, 4 с переменной облачностью и 1 пасмурный день. Дожди преимущественно умеренные. В сентябре, а также в январе, феврале, апреле и мае Балыкча cчитается местом, некомфортным для посещения.