Сентябрь в Байонне — самый солнечный месяц в году. В сентябре климат в Байонне можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 23 градуса тепла. В среднем в сентябре в Байонне 17 ясных, 7 дождливых и 6 дней с переменной облачностью. Дожди преимущественно сильные. В сентябре, а также в августе Байонна cчитается местом, комфортным для посещения.