В сентябре климат в Шибугамо можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 13 градусов тепла. В среднем в сентябре в Шибугамо 17 дождливых, 6 ясных, 4 пасмурных и 3 дня с переменной облачностью. Дожди преимущественно умеренные. В сентябре, а также в январе, феврале, апреле и мае Шибугамо cчитается местом, некомфортным для посещения.