В июне климат в Чолутеке можно охарактеризовать как жаркий. Средняя температура днём в июне 29 градусов тепла. В среднем в июне в Чолутеке 26 дождливых, 2 ясных, 1 пасмурный и 1 день с переменной облачностью. Дожди преимущественно сильные. В июне, а также в мае, августе, сентябре и октябре Чолутека cчитается местом, некомфортным для посещения.