В ноябре климат в Глубока над Влтавой можно охарактеризовать как холодный. Средняя температура днём в ноябре 6 градусов тепла. В среднем в ноябре в Глубока над Влтавой 13 пасмурных, 6 дождливых, 6 с переменной облачностью и 5 ясных дней. Дожди преимущественно слабые. В ноябре, а также в январе, феврале, марте и апреле Глубока над Влтавой cчитается местом, некомфортным для посещения.