В сентябре климат в Калгалакше можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 11 градусов тепла. В среднем в сентябре в Калгалакше 12 дождливых, 11 пасмурных, 4 ясных и 3 дня с переменной облачностью. Дожди преимущественно умеренные. В сентябре, а также в апреле, мае и октябре Калгалакша cчитается местом, некомфортным для посещения.