В сентябре климат в Сан Мануэле можно охарактеризовать как жаркий. Средняя температура днём в сентябре 32 градуса тепла. В среднем в сентябре в Сан Мануэле 23 ясных и 7 дождливых дней. Дожди преимущественно умеренные.