В январе климат в Сан-Томе можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в январе 27 градусов тепла. В среднем в январе в Сан-Томе 24 дождливых, 5 ясных и 2 дня с переменной облачностью. Дожди преимущественно умеренные. В январе, а также в феврале, марте, апреле и октябре Сан-Томе cчитается местом, некомфортным для посещения.