В апреле климат в Шенкурске можно охарактеризовать как холодный. Средняя температура днём в апреле 4 градуса тепла. В среднем в апреле в Шенкурске 15 дождливых, 14 пасмурных и 1 ясный день. Дожди преимущественно умеренные. В апреле, а также в январе, сентябре и октябре Шенкурск cчитается местом, некомфортным для посещения.