В сентябре климат в Агиа-Марине можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 24 градуса тепла. В среднем в сентябре в Агиа-Марине 28 ясных и 2 дождливых дня. Дожди преимущественно слабые. В сентябре, а также в мае, июне, июле и августе Агиа-Марина cчитается местом, комфортным для посещения.