В сентябре климат в Чистоозерном можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 14 градусов тепла. В среднем в сентябре в Чистоозерном 13 пасмурных, 7 ясных, 7 с переменной облачностью и 3 дождливых дня. Дожди преимущественно слабые.