В июне климат в Котону можно охарактеризовать как жаркий. Средняя температура днём в июне 28 градусов тепла. В среднем в июне в Котону 27 дождливых, 2 ясных и 1 пасмурный день. Дожди преимущественно сильные. В июне, а также в марте, мае, июле и августе Котону cчитается местом, некомфортным для посещения.