Май в Глубока над Влтавой — самый дождливый месяц в году. В мае климат в Глубока над Влтавой можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в мае 16 градусов тепла. В среднем в мае в Глубока над Влтавой 14 дождливых, 9 ясных, 6 с переменной облачностью и 2 пасмурных дня. Дожди преимущественно умеренные. В мае, а также в январе, феврале, марте и апреле Глубока над Влтавой cчитается местом, некомфортным для посещения.