В сентябре климат в Итанагаре можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 26 градусов тепла. В среднем в сентябре в Итанагаре 27 дождливых и 3 ясных дня. Дожди преимущественно сильные. В сентябре, а также в апреле, мае, июне и июле Итанагар cчитается местом, некомфортным для посещения.