В июне климат в Джаяпуре можно охарактеризовать как жаркий. Средняя температура днём в июне 28 градусов тепла. В среднем в июне в Джаяпуре 25 дождливых, 4 ясных и 1 пасмурный день. Дожди преимущественно сильные. В июне, а также в январе, феврале, марте и апреле Джаяпура cчитается местом, некомфортным для посещения.