В сентябре климат в Костоме можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 13 градусов тепла. В среднем в сентябре в Костоме 15 дождливых, 11 пасмурных, 3 ясных и 1 день с переменной облачностью. Дожди преимущественно умеренные. В сентябре, а также в январе, апреле и октябре Костома cчитается местом, некомфортным для посещения.