В сентябре климат в Кюстендиле можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 20 градусов тепла. В среднем в сентябре в Кюстендиле 18 ясных, 9 дождливых и 3 дня с переменной облачностью. Дожди преимущественно умеренные.