В июне климат в Кызыл-Кале можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в июне 19 градусов тепла. В среднем в июне в Кызыл-Кале 17 дождливых и 13 ясных дней. Дожди преимущественно сильные. В июне, а также в феврале, марте и мае Кызыл-Кала cчитается местом, некомфортным для посещения.