В сентябре климат в Македонии можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 21 градус тепла. В среднем в сентябре в Македонии 14 ясных, 9 с переменной облачностью и 7 дождливых дней. Дожди преимущественно умеренные. В сентябре, а также в августе Македония cчитается местом, комфортным для посещения.