В июне климат в Малягурте можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в июне 20 градусов тепла. В среднем в июне в Малягурте 11 дождливых, 10 с переменной облачностью, 7 ясных и 2 пасмурных дня. Дожди преимущественно умеренные.