В сентябре климат в Малыкае можно охарактеризовать как холодный. Средняя температура днём в сентябре 7 градусов тепла. В среднем в сентябре в Малыкае 20 пасмурных, 6 дождливых и 4 ясных дня. Дожди преимущественно слабые.