В сентябре климат в Новотроицком можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 16 градусов тепла. В среднем в сентябре в Новотроицком 13 дождливых, 10 ясных, 5 с переменной облачностью и 2 пасмурных дня. Дожди преимущественно сильные.