В июне климат в Какортоке можно охарактеризовать как холодный. Средняя температура днём в июне 8 градусов тепла. В среднем в июне в Какортоке 11 дней с переменной облачностью, 8 ясных, 7 дождливых и 4 пасмурных дня. Дожди преимущественно умеренные. В июне, а также в апреле, мае, июле и августе Какорток cчитается местом, некомфортным для посещения.