В сентябре климат в Селенгинске можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 11 градусов тепла. В среднем в сентябре в Селенгинске 11 ясных, 11 с переменной облачностью, 7 дождливых и 1 пасмурный день. Дожди преимущественно слабые.