В сентябре климат в Сыгыннахе можно охарактеризовать как холодный. Средняя температура днём в сентябре 8 градусов тепла. В среднем в сентябре в Сыгыннахе 9 дней с переменной облачностью, 8 дождливых, 7 ясных и 6 пасмурных дней. Дожди преимущественно умеренные.