В сентябре климат в Трухильо можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 25 градусов тепла. В среднем в сентябре в Трухильо 24 дождливых, 3 пасмурных, 2 ясных и 1 день с переменной облачностью. Дожди преимущественно сильные. В сентябре, а также в апреле, мае, июне и июле Трухильо cчитается местом, некомфортным для посещения.