В сентябре климат в Верхнем Авзяне можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 13 градусов тепла. В среднем в сентябре в Верхнем Авзяне 14 дождливых, 6 ясных, 6 с переменной облачностью и 4 пасмурных дня. Дожди преимущественно умеренные. В сентябре, а также в январе, феврале, апреле и октябре Верхний Авзян cчитается местом, некомфортным для посещения.