Одна из сохранившихся крепостных монастырских башен. После Смутного времени и польско-литовской осады монастыря было принято решение об усилении оборонительных возможностей обители. В 1621—1646 были построены более мощные крепостные стены с башнями, в том числе и Богородицкая башня, построенная первой из новых башен, в 1623 году. Башня была названа по имени Рождество-Богородицкого храма, на месте которого сейчас установлен памятник князю Ярославу Мудрому. К концу 17 века длина стен достигала 820 метров, высота – 10,5 метров, толщина – до 3 метров. Богородицкая башня глухая (непроездная) квадратного сечения, с глубокими подвалами с подземным ходом. Башня была подведена под пирамидальную кровлю, на которую был установлен позолоченный флажок. 24- метровая башня имела несколько 4 боевых яруса и несколько рядов бойниц, в том числе щелевые бойницы под кровлей и бойницы подошвенного боя. Вооружена была изначально большими и малыми пищалями, а также ручным огнестрельным оружием. Ярославские епархиальные ведомости" за 1896 год приводят текст надписи, сделанной на стене монастырской ограды вблизи Богородской башни: "Лета 7131 (1623) июля в 24 день сделана бысть сия башня и две башни от Которости начаты в 7130 (1622) году при державе Государя Царя и Великого Князя Михаила Феодоровича всея России самодержца и отца его Великого Государя святейшего Филарета Никитича, патриарха Московского и всея России благословением". В 1896 году архиепископом Ярославским и Ростовским Ионафаном (Иоанном Наумовичем Рудневым) в нижнем ярусе Богородской башни была устроена Троицкая часовня, в честь пребывания в монастыне в 1613 году первого русского царя из династии Романовых Михаила Федоровича. Также, по благословению архиепископа Ионафана, губернским инженером Владимиром Ивановичем Шишкиным в 1895 году проведена реставрация башни, в связи с ее ветхостью. Шатёр заменили барочным колпаком, а саму башню украсили измельчёнными псевдорусскими деталями. Башня пострадала при артиллирейском обстреле во время белогвардейского восстания 1918 года. Отремонтирована и отреставрирована вм1923 году под руководством архитектора Ивана Ивановича Князева и историка, археологаи реставратора Иллариона Александровича Тихомирова. Интересно: во времена распространения лошадиной тяги, до начала 20 века здесь исторически сложилось место стоянки местных ярославских гужевых извозчиков.